Passa al contingut principal

Master Student - Computational Biology Group (R0) per el Barcelona Supercomputing Center

The Computational Biology group, led by ICREA professor Alfonso Valencia, is looking for a Master student to work on a multiscale modelling project, and more specifically, on the modelling of COVID-19 infection dynamics combining an upper airways simulator (Alya) together with a simulator of the infection of the epithelial epithelium (PhysiBoSS). The project will involve the building of a digital twin of a drug assay in COVID-19 patients that identifies the best treatment for each patient and condition. To do so, the student will need to bridge from the virus delivery on the lung epithelial cells and its effects on the cells’ pathways up to the distribution of viruses in the different alveoli to find interventions points in the COVID-19 infection of lung cells that explain the different patients’ response. The successful candidate will join a dynamic research group within the Life Sciences department, which integrates independent senior scientists that work on various aspects of computational biology, ranging from bioinformatics for genomics and proteomics to computational biochemistry and text mining. The Researcher will work in a highly sophisticated HPC environment, have access to systems and computational infrastructures, and establish collaborations with experts in different areas.

Key Duties

  • Gather data from publicly available databases and gather information on COVID-19 treatments that allow for the tailoring of the multiscale simulation to each patient subtype.
  • Explore the use of clinical data (transcriptomics, anatomopathological images, etc) to personalise models to patients with different COVID-19 symptoms.
  • Query these digital twins to identify intervention points that may be specific for a given subset of patients.
  • Define the interaction between the tools and their integration into a common workflow that scales efficiently in HPC systems such as MareNostrum 4 and 5.
  • Collaborate in the preparation and presentation of research projects.
  • Participate in internal group meetings and other scientific discussions

Data de tancament: Dissabte, 16 Desembre, 2023

Més informació

Més posts de Recerca

Comentaris

Entrades populars d'aquest blog

Oferta pública 10/07/2024

  Ajuntament de Rubí 2 places de Tècnic mitjà Barcelona Supercomputing Center-Centro Nacional de Supercomputación (BSC-CNS) 1 plaça de Research Engineer - Use of acoustic information in chatbots (RE1) Centre de Ciència i Tecnologia Forestal de Catalunya (CTFC) 1 plaça de Cap de grup recerca Centre de Ciència i Tecnologia Forestal de Catalunya (CTFC) 1 plaça de Responsable de projectes transversals Diputació de Girona - Organisme Autònom de Salut Pública (Dipsalut) 2 places de Tècnic informàtic Fundació i2CAT, Internet i Innovació Digital a Catalunya 1 plaça de Senior 6G Researcher Generalitat de Catalunya - Centre de la Propietat Forestal (CPF) 2 places d'Enginyer tècnic forestal o equivalent al Centre de la Propietat Forestal a Santa Perpètua de Mogoda Generalitat de Catalunya - Departament d'Acció Climàtica, Alimentació i Agenda Rural 1 plaça de Titulat superior enginyer de forest a la Direcció General de Boscos i Gestió del Medi Generalitat de Catalunya - Departament d'A

Oferta pública 08/07/2024

  Ajuntament de la Garriga 1 plaça de Tècnic mitjà - tècnic de contractació Ajuntament de Vilanova i la Geltrú - Institut Municipal d'Educació i Treball (IMET) Borsa de treball de places de Tècnic especialista per a l'execució del Programa Curs EFAV 2024-2025 Barcelona Regional, Agència de Desenvolupament Urbà, SA Borsa de treball de places d'Especialista en disseny de traçat viari i ferroviari i encaix d'infraestructures del transport Consorci de la Vall del Ges, Orís i Bisaura 1 plaça de Tècnic de programes educatius i de promoció i comunicació del castell de Montesquiu Consorci de l'Habitatge de l'Àrea Metropolitana de Barcelona 2 places de Tècnic suport adscrit a l'Àrea de Processos i Operativa Consorci per a la Construcció, Equipament i Explotació del Laboratori de Llum Sincrotró (CELLS) 1 plaça de RF scientist/engineer Consorci per a la Construcció, Equipament i Explotació del Laboratori de Llum Sincrotró (CELLS) 1 plaça de Digital Low Level RF scienti

Oferta púbica 09/07/2024

  Ajuntament de la Bisbal d'Empordà Borsa de treball de places de Tècnic mitjà de la via pública Centre Internacional de Mètodes Numèrics a l'Enginyeria (CIMNE) 1 plaça de Tècnic mitjà de servei de persones - Relacions Laborals Centre Internacional de Mètodes Numèrics a l'Enginyeria (CIMNE) 1 plaça de Tècnic de PreAward del departament de Projectes Empresa de Transformación Agraria, SA, SME, MP (TRAGSA) 1 plaça de Tècnic d'Electrònica i/o Informàtica - Pesca i Assumptes Marítims (Bucs Oceanogràfics) Generalitat de Catalunya - Departament de Territori 1 plaça de Diplomat enginyer tècnic d'obres públiques a la Direcció General d'Infraestructurs de Mobilitat Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) 1 plaça de Senior Laboratory Technician at the Spatial Biotechnology Research Group Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) 1 plaça de Senior Researcher at the Cellular and Molecular Mechanobiology Research Group Síndic de Greuges de Catalunya 1 plaça de Tècni