Passa al contingut principal

Master Student - Computational Biology Group (R0) per el Barcelona Supercomputing Center

The Computational Biology group, led by ICREA professor Alfonso Valencia, is looking for a Master student to work on a multiscale modelling project, and more specifically, on the modelling of COVID-19 infection dynamics combining an upper airways simulator (Alya) together with a simulator of the infection of the epithelial epithelium (PhysiBoSS). The project will involve the building of a digital twin of a drug assay in COVID-19 patients that identifies the best treatment for each patient and condition. To do so, the student will need to bridge from the virus delivery on the lung epithelial cells and its effects on the cells’ pathways up to the distribution of viruses in the different alveoli to find interventions points in the COVID-19 infection of lung cells that explain the different patients’ response. The successful candidate will join a dynamic research group within the Life Sciences department, which integrates independent senior scientists that work on various aspects of computational biology, ranging from bioinformatics for genomics and proteomics to computational biochemistry and text mining. The Researcher will work in a highly sophisticated HPC environment, have access to systems and computational infrastructures, and establish collaborations with experts in different areas.

Key Duties

  • Gather data from publicly available databases and gather information on COVID-19 treatments that allow for the tailoring of the multiscale simulation to each patient subtype.
  • Explore the use of clinical data (transcriptomics, anatomopathological images, etc) to personalise models to patients with different COVID-19 symptoms.
  • Query these digital twins to identify intervention points that may be specific for a given subset of patients.
  • Define the interaction between the tools and their integration into a common workflow that scales efficiently in HPC systems such as MareNostrum 4 and 5.
  • Collaborate in the preparation and presentation of research projects.
  • Participate in internal group meetings and other scientific discussions

Data de tancament: Dissabte, 16 Desembre, 2023

Més informació

Més posts de Recerca

Etiquetas:

Comentaris

Publica un comentari a l'entrada

Entrades populars d'aquest blog

La ciberseguretat a Catalunya

El sector de la ciberseguretat és un element cada vegada més fonamental per a les empreses que tenen presència i activitat a escala digital, ja sigui a través d’internet com en la gestió de dades i processos interns de la pròpia companyia. Per això, tal com recull l’actualització de l’informe 'La ciberseguretat a Catalunya,' elaborat per ACCIÓ i l’Agència de Ciberseguretat de Catalunya, ja hi ha 516 empreses que desenvolupen el seu model de negoci en aquest sector. Xifra que representa un creixement del 50% respecte els darrers cinc anys. Pel que fa a volum de negoci, el 2022 (darreres dades disponibles) el sector va generar 1.244 milions d’euros, un 16% més que l’any anterior, i un creixement del 54% respecte els darrers sis anys. Les empreses de ciberseguretat donen feina a més de 9.400 persones, un 15% més que el 2021. [PÍNDOLA] La ciberseguretat a Catalunya CAT EN Descarrega l'informe complet Més posts de Mercat de treball
Publica un comentari a l'entrada
Més informació

Pràctiques Ciberseguretat - Consultoria a UPCnet

Som l'empresa de consultoria i serveis digitals avançats de la Universitat Politècnica de Catalunya (UPC). Proporcionem a la UPC serveis TIC amb la màxima fiabilitat, rendibilitat i amb evolució constant per donar suport a l’estratègia de la Universitat. Combinem el coneixement generat a la UPC amb el talent i l'experiència del nostre equip format per més de 250 professionals de l’enginyeria i la consultoria, adquirida treballant en projectes i empreses líders des de fa més de 20 anys. Facilitem el creixement de les persones del nostre equip perquè siguin les i els líders tecnològics del futur. Ho fem en un bon ambient de treball i amb condicions flexibles. El teu repte Col·laborar en diverses oficines tècniques de seguretat, donant suport al rol de CISO i assistència en la revisió i elaboració de polítiques i procediments de seguretat, gestió de riscos, plans de continuïtat, programes de dinamització de la ciberseguretat, elaboració de píndoles formatives... Participar en proj
Publica un comentari a l'entrada
Més informació

Els semiconductors a Catalunya

Els semiconductors per a la fabricació de xips estan dissenyats específicament per proporcionar als dispositius i circuits integrats la capacitat de processar, emmagatzemar i transmetre dades. Així, els materials semiconductors són un element crucial en l'electrònica moderna i constitueixen un component important de molts dispositius electrònics d'ús habitual, com ara telèfons intel·ligents, tauletes i ordinadors, però també de tots els dispositius que han anant incorporant elements digitals i de connectivitat. És el cas dels automòbils, l’equipament mèdic, els data centers o els aparells automatitzats. En xifres globals, el 2024 els ingressos de la indústria mundial de semiconductors arribaran als 588.360 milions de dòlars, un augment del 13% respecte l'any anterior. De cara a futur, s'espera que la indústria mundial dels xips de semiconductors creixi a un ritme del 6,3% anual fins al 2027. I nforme complet Els semiconductors a Catalunya Píndola: Els semiconductors a C
Publica un comentari a l'entrada
Més informació